O Agrupamento de Escolas de Vila Flor conta com 8 escolas, desde o 1º ciclo ao Ensino Secundário. A sede do Agrupamento de Escolas localiza-se na Escola Básica 2,3/ S de Vila Flor, onde se encontram os alunos do 5º ao 12º ano.

No ensino secundário os alunos têm 3 opções diferentes a seguir: Curso de Ciências e Tecnologias, Curso Científico-Humanístico ou Curso Profissional de Técnico Auxiliar de Saúde.

Relativamente ao 1º ciclo existem 7 escolas no concelho e a maior parte localiza-se nas aldeias: Dr. Artur Pimentel (Vila Flor), Samões, Vilas Boas, Freixiel, Benlhevai, Seixo de Manhoses e Santa Comba da Vilariça.

O Agrupamento de Escolas de Vila Flor tem como prioridade a educação de todos os jovens do concelho, de modo que tenham sucesso no futuro profissional.